歡迎使用科研助手
你好,請 登錄 | 免費注冊

當前位置:科研助手>服務項目>服務項目詳情

 PLS-DA/OPLS-DA二維圖

服務價格:

服務分類:醫藥制品檢測

所用儀器:

依據標準號:

依據標準號:

北京百泰派克生物科技有限公司

負責人:李欣

聯系人:李欣

聯系電話:010-57231915 15201377680

Email:info@biotech-pack.com

咨詢 簽訂合同


不同于主成分分析( PCA)法,偏最小二乘判別分析( Partial Least Squares Discrimination Analysis, PLS-DA)或正交偏最小二乘判別分析( Orthogonal PLS-DA,OPLS-DA)是一種有監督的判別分析統計方法。該方法運用偏最小二乘回歸建立代謝物表達量與樣品類別之間的關系模型,來實現對樣品類別的預測。分別建立兩兩分組比較的PLS-DA模型(圖1)或OPLS-DA模型(圖2),模型得到的參數評價會以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分別表示所建模型對X和Y矩陣的解釋率,Q2標示模型的預測能力,理論上R^2、Q^2數值越接近1說明模型越好,越低說明模型的擬合準確性越差,通常情況下,R^2、Q^2高于0.5 (50%)較好,高于0.4即可接受,且兩者差值不應過大。臨床樣本由于個體差異大,不可控,尤其大樣本時,R^2、Q^2大小為0.2左右亦可。圖3則是對PLS-DA模型(c)的檢驗,直線的斜率大,Q^2的截距為X,說明PLS-DA模型沒有過擬合。同時通過計算變量投影重要度( Variable Importance for the Projection, VIP)來衡量各代謝物的表達模式對各組樣本分類判別的影響強度和解釋能力, 從而輔助標志代謝物的篩選(通常以 VIP值 > 1.0 作為篩選標準)(圖4)。

百泰派克采用 QC 樣本譜圖比對和主成分分析兩種方法,對本項目實驗中的 QC 樣本數據進行分析評價。將分析得到的QC樣本 UPLC-QTOF-MS 總離子流圖,進行譜圖重疊比較圖1 假手術組和模型組的PLS-DA 得分圖百泰派克采用 QC 樣本譜圖比對和主成分分析兩種方法,對本項目實驗中的 QC 樣本數據進行分析評價。將分析得到的QC樣本 UPLC-QTOF-MS 總離子流圖,進行譜圖重疊比較圖2 假手術組和模型組的OPLS-DA模型百泰派克采用 QC 樣本譜圖比對和主成分分析兩種方法,對本項目實驗中的 QC 樣本數據進行分析評價。將分析得到的QC樣本 UPLC-QTOF-MS 總離子流圖,進行譜圖重疊比較圖 3 PLS-DA模型的排列檢驗圖百泰派克采用 QC 樣本譜圖比對和主成分分析兩種方法,對本項目實驗中的 QC 樣本數據進行分析評價。將分析得到的QC樣本 UPLC-QTOF-MS 總離子流圖,進行譜圖重疊比較圖 4 假手術組和模型組的PLS-DA 模型載荷圖

注:紅框所圈的點為VIP>1的代謝產物

How to order?


  • 20/02/06 22:05

    *

    PLS-DA模型

    模型與判別率
合同甲方 送樣單號 合同編號 評價 評語 評價日期
相關服務

免費發布咨詢信息!

與實驗室管理人員面對面溝通。

PLS-DA/OPLS-DA二維圖

上海11选5-安全购彩